我國科學儀器工業經過３０多年的發展，雖然已經具備一定開發和生產能力，但目前還面臨著一些問題：儀器的性能指標和穩定性、可靠性差；國家對科學儀器研究開發的投入不夠；沒有形成儀器開發同生產結合的機技術優勢。
國家重視科學儀器，一些儀器開發企業與原創性研發團隊大大受益，極大地促進了科學儀器的發展。但有一些原來并不一定具有開發能力的單位，也開始投入其中，因此，帶出一些新的問題：
1.科學儀器開發人才本來有限，人才有限怎么辦？有的單位從零開始，馬上招人加入到科學儀器開發的大軍中，使原來很少的人更分散了。有些單位提高工資，一下子把人才成本提高到一定的高度。
10月30日，廣州市委組織部解讀《關于推進人才集聚工程的實施意見》時透露，今起5年內，廣州將實現“重點引進和培養高層次人才約2000名，全市大專以上學歷人才總量約320萬名，并初步建成輻射華南、服務全國、連通普遍的‘人才港’”。
2.為了參與項目競爭，有些單位不合理地提高了待研發儀器的指標，或是為了拿到項目，不斷提出新概念。其負面影響是，一方面領導以為國內水平真的很高，有可能跨越式發展，有了不合理的期望和期待；另一方面，真正在做儀器的單位不一定申請到課題，或是反而被認為水平不高。
科學儀器，在我們國家就是一個追趕的過程，拿出與國外類似水平的儀器，甚至只要儀器性能穩定，即使技術指標差一點就已經很好了。實際上，科學儀器開發要有很好的團隊基礎以及很好的工業基礎，二者都很難短期內發展到更高的水平。已經有很好的參照物，既不必提更高的指標，也不必提新概念。所以，科學儀器行業不能變成像IT行業一樣，成為燒錢的行業；科學儀器行業也不能是急功近利的行業。
我國科學儀器儀表行業還需穩中求進，增強我國科學儀器的整體水平。
